亲兄妹结婚属于近亲结婚，是违法的，一旦被查出，孩子会因此上不了户口。另外近亲结婚所出的后代很容易患病或畸形，发病概率比普通孩子要高，即使侥幸健康，也会比普通孩子体质弱。
一、法律层面的影响
直系血亲和三代以内的旁系血亲关系是禁止结婚的，亲兄妹结婚就属于近亲结婚，根据我国《婚姻法》第七条规定，近亲结婚是违法的。一旦被查出，近亲结婚的后代会此上不了户口，是有很大影响的。
二、医学层面的影响
1、近亲结婚的后代患隐性遗传病的概率，高出非近亲结婚后代150倍。
2、近亲结婚所出的孩子，容易患先天性心脏病、脑瘫等多基因病症。
3、近亲结婚的孩子早期死亡率和畸形率也比较高。
4、近亲结婚生的孩子，体质会比较差，体重较轻，身高较矮。
